Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms