Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pde1bQ01065 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms