Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms