Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms