Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms