Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn1bP97952 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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