Protein–RNA interactions for Protein: P97770

Thumpd3, THUMP domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd3P97770 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd3P97770 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms