Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas2P97460 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas2P97460 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas2P97460 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms