Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps3aP97351 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms