Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SgcdP82347 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcdP82347 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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