Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irf3P70671 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irf3P70671 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Irf3P70671 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Irf3P70671 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irf3P70671 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irf3P70671 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Irf3P70671 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irf3P70671 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irf3P70671 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irf3P70671 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irf3P70671 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irf3P70671 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irf3P70671 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Irf3P70671 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Irf3P70671 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Irf3P70671 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf3P70671 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf3P70671 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf3P70671 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf3P70671 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.5 ms