Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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