Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeboxP70368 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeboxP70368 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeboxP70368 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SeboxP70368 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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