Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms