Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stra8P70278 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stra8P70278 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stra8P70278 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stra8P70278 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Stra8P70278 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Stra8P70278 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stra8P70278 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms