Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NficP70255 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NficP70255 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NficP70255 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NficP70255 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NficP70255 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NficP70255 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NficP70255 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NficP70255 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NficP70255 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NficP70255 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NficP70255 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NficP70255 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NficP70255 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NficP70255 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NficP70255 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NficP70255 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NficP70255 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NficP70255 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NficP70255 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NficP70255 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NficP70255 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NficP70255 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NficP70255 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NficP70255 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NficP70255 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NficP70255 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NficP70255 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NficP70255 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NficP70255 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NficP70255 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NficP70255 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NficP70255 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NficP70255 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NficP70255 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms