Protein–RNA interactions for Protein: P68373

Tuba1c, Tubulin alpha-1C chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba1cP68373 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tuba1cP68373 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba1cP68373 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms