Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms