Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nphp4P59240 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp4P59240 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp4P59240 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp4P59240 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp4P59240 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp4P59240 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp4P59240 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp4P59240 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp4P59240 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp4P59240 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp4P59240 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp4P59240 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp4P59240 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp4P59240 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp4P59240 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp4P59240 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp4P59240 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp4P59240 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nphp4P59240 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nphp4P59240 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp4P59240 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms