Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp3P58854 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms