Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms