Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms