Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcanP55066 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcanP55066 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NcanP55066 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcanP55066 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NcanP55066 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcanP55066 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcanP55066 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcanP55066 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcanP55066 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcanP55066 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcanP55066 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcanP55066 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcanP55066 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcanP55066 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcanP55066 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcanP55066 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NcanP55066 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NcanP55066 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NcanP55066 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcanP55066 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcanP55066 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcanP55066 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcanP55066 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcanP55066 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcanP55066 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcanP55066 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcanP55066 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcanP55066 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NcanP55066 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcanP55066 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcanP55066 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcanP55066 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcanP55066 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcanP55066 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcanP55066 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcanP55066 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcanP55066 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcanP55066 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcanP55066 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcanP55066 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NcanP55066 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcanP55066 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NcanP55066 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcanP55066 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcanP55066 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcanP55066 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcanP55066 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcanP55066 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcanP55066 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcanP55066 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcanP55066 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcanP55066 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcanP55066 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcanP55066 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcanP55066 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcanP55066 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NcanP55066 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcanP55066 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcanP55066 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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NcanP55066 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcanP55066 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcanP55066 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcanP55066 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcanP55066 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcanP55066 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcanP55066 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NcanP55066 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcanP55066 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcanP55066 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcanP55066 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcanP55066 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcanP55066 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcanP55066 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcanP55066 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcanP55066 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NcanP55066 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcanP55066 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NcanP55066 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcanP55066 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcanP55066 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcanP55066 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcanP55066 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcanP55066 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms