Protein–RNA interactions for Protein: P51943

Ccna2, Cyclin-A2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna2P51943 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccna2P51943 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms