Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa-rs12P50716 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms