Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa8P50706 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms