Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt6aP50446 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms