Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpreP49446 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpreP49446 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpreP49446 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpreP49446 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpreP49446 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpreP49446 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpreP49446 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpreP49446 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtpreP49446 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtpreP49446 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms