Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

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Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb41P48193 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb41P48193 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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