Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf1P46099 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf1P46099 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf1P46099 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf1P46099 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf1P46099 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms