Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syt1P46096 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syt1P46096 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syt1P46096 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syt1P46096 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syt1P46096 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syt1P46096 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syt1P46096 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syt1P46096 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syt1P46096 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syt1P46096 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syt1P46096 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syt1P46096 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syt1P46096 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syt1P46096 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syt1P46096 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syt1P46096 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syt1P46096 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syt1P46096 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syt1P46096 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syt1P46096 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syt1P46096 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syt1P46096 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syt1P46096 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syt1P46096 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syt1P46096 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syt1P46096 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syt1P46096 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syt1P46096 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syt1P46096 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syt1P46096 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syt1P46096 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms