Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx1P43345 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms