Protein–RNA interactions for Protein: P41158

Elk4, ETS domain-containing protein Elk-4, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk4P41158 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk4P41158 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk4P41158 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk4P41158 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk4P41158 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk4P41158 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Elk4P41158 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms