Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lig1P37913 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lig1P37913 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig1P37913 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig1P37913 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig1P37913 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig1P37913 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig1P37913 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms