Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc3P33622 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms