Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rom1P32958 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rom1P32958 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rom1P32958 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rom1P32958 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rom1P32958 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rom1P32958 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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