Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms