Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprmP28828 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprmP28828 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprmP28828 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprmP28828 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprmP28828 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprmP28828 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprmP28828 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprmP28828 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprmP28828 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprmP28828 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
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