Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BgnP28653 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BgnP28653 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BgnP28653 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BgnP28653 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BgnP28653 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BgnP28653 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BgnP28653 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BgnP28653 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BgnP28653 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BgnP28653 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BgnP28653 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BgnP28653 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BgnP28653 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BgnP28653 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BgnP28653 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BgnP28653 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BgnP28653 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BgnP28653 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BgnP28653 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BgnP28653 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BgnP28653 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BgnP28653 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BgnP28653 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BgnP28653 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BgnP28653 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BgnP28653 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BgnP28653 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BgnP28653 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BgnP28653 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BgnP28653 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BgnP28653 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BgnP28653 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BgnP28653 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BgnP28653 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BgnP28653 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BgnP28653 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BgnP28653 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BgnP28653 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BgnP28653 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BgnP28653 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BgnP28653 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BgnP28653 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BgnP28653 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms