Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LoxP28301 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LoxP28301 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LoxP28301 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LoxP28301 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LoxP28301 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LoxP28301 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LoxP28301 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LoxP28301 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LoxP28301 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LoxP28301 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LoxP28301 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LoxP28301 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LoxP28301 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LoxP28301 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LoxP28301 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LoxP28301 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LoxP28301 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LoxP28301 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LoxP28301 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LoxP28301 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LoxP28301 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LoxP28301 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LoxP28301 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LoxP28301 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LoxP28301 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LoxP28301 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LoxP28301 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LoxP28301 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LoxP28301 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LoxP28301 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LoxP28301 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LoxP28301 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LoxP28301 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LoxP28301 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LoxP28301 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LoxP28301 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LoxP28301 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LoxP28301 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LoxP28301 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LoxP28301 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LoxP28301 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LoxP28301 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LoxP28301 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LoxP28301 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LoxP28301 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LoxP28301 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LoxP28301 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LoxP28301 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms