Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms