Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af2P26369 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af2P26369 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af2P26369 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af2P26369 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
U2af2P26369 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
U2af2P26369 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms