Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms