Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NelfeP19426 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NelfeP19426 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NelfeP19426 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NelfeP19426 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NelfeP19426 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms