Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl9P18340 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl9P18340 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms