Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtsdP18242 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtsdP18242 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms