Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrgnP13609 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrgnP13609 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrgnP13609 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrgnP13609 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrgnP13609 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrgnP13609 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrgnP13609 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SrgnP13609 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SrgnP13609 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrgnP13609 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrgnP13609 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SrgnP13609 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrgnP13609 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms