Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nr4a1P12813 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms