Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcl2P10889 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms