Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms